Für den Naturschutzpreis der Stiftung können Einzelpersonen, Verbände, Vereine, Institutionen, Initiativen oder auch Unternehmen vorgeschlagen werden. Vorschlagsberechtigt ist jedermann. Auch Preisträger aus Regionen außerhalb des Bundeslandes können ausgezeichnet werden, wenn sie sich in besonderem Maße um den Schutz von Natur und Landschaft in Brandenburg verdient gemacht haben.

Die Auswahl der Preisträger trifft der Stiftungsrat auf seiner Frühjahrssitzung im Mai. Die Auszeichnung wird durch die Ministerin dann auf der Herbstsitzung überreicht. Der Naturschutzpreis der Stiftung NaturSchutzFonds Brandenburg wird alle zwei Jahre ausgelobt. Dabei kann es sich neben praktischen Naturschutzmaßnahmen auch um wissenschaftliche, planerische oder wirtschaftliche Leistungen handeln, die ausgezeichnet werden.

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